המרכז החינוכי בחנתון הוקם בשנת 1989, לזכרם של רב סיימון ובטי גרינבגר, כעמותה ששמה לה למטרה לעסוק בסוגיות שונות ביהדות ובכך להעצים את התנועה המסורתית בישראל ובעולם כולו. המרכז החינוכי נוסד כשופר של קיבוץ חנתון – הקיבוץ הקונסרבטיבי הראשון בישראל, שחרט על דגלו לא רק לקיים את עצמו, אלא גם לעסוק בחינוך וברוח החברה הישראלית.

בשנת 1993 הוקם מרכז ההארחה, בראשותו של הרב אלי חביב ולאחר מכן בראשותו של הרב איתן שיקלי, שיזם והקים את תוכנית בני המצווה המוצלחת שמילאה את המקום בנערים ובנערות מבתי ספר רבים מכל הארץ שבאו ללמוד, לחוות ולבלות.